4. Pemilu 1999
Wakil Presiden BJ. Habibie dilantik menjadi presiden pada 1998. Pemilu yang rencana digelar pada 2002 dipercepat menjadi Pemilu 1999.
Pemilu 1999 menjadi pemilu pertama pada masa reformasi. Pemilu ini diikuti 48 partai politik. Pemilu yang dilaksanakan pada 7 Juni 1999 ini memilih anggota DPR, DPD, dan DPRD.
Sementara MPR menetapkan Presiden Abdurrahman Wahid dan Wakil Presiden Megawati Soekarnoputri. Namun, berdasarkan Sidang Istimewa MPR RI 23 Juli 2001 melalui Ketetapan MPR RI Nomor II/MPR/2001pada 2001, presiden dan wakil presiden diganti Megawati Soekarnoputri-Hamzah Haz.
5. Pemilu 2004
Pemilu pertama pasca perubahan amandemen UUD 1945 ini membawa tiga perubahan dalam pesta demokrasi di Indonesia. Pertama, presiden dan wakil presiden dipilih langsung oleh rakyat. Kedua, dibentuk Dewan Perwakilan Daerah (DPD). Ketiga, pembentukan KPU sebagai penyelenggara pemilu yang bersifat nasional, tetap, dan mandiri.
Pemilu 2004 memilih anggota DPR, DPD, dan DPR. Pileg 2004 diikuti 24 partai politik dan diselenggarakan pada 5 April 2004. Pemilu 2004 juga menjadi pemilihan umum pertama untuk memilih presiden dan wakil presiden. Pilpres 2004 berlangsung dalam dua putaran dan diikuti lima pasangan calon presiden dan wakil presiden.
Putaran pertama digelar pada 5 Juli 2004 dan putaran kedua pada 20 September 2004. Susilo Bambang Yudhoyono dan Jusuf Kalla terpilih sebagai presiden dan wakil presiden periode 2004-2009.
6. Pemilu 2009
Sejak saat itu, pemilu diselenggarakan setiap lima tahun sekali. Sehingga pemilu selanjutnya adalah Pemilu 2009 untuk memilih DPR, DPD, DPRD, dan presiden-wakil presiden.
Pileg 2009 dilaksanakan pada 9 April 2009. Peserta pemilu sebanyak 44 partai politik terdiri dari 33 partai politik nasional dan enam partai lokal Aceh. Sementara Pilpres 2009 dilaksanakan pada 8 Juli 2009 dan berlangsung satu putaran. Terdapat tiga pasangan calon. Susilo Bambang Yudhoyono dan Boediono terpilih sebagai presiden dan wakil presiden periode 2009-2014.
7. Pemilu 2014
Pemilu 2014 untuk memilih anggota DPR, DPD, dan DPRD dilaksanakan pada 9 April 2014 di dalam negeri. Sementara pemilu di luar negeri dilaksanakan lebih awal pada 30 Maret hingga 6 April 2014.
Pilpres 2014 dilaksanakan pada 9 Juli 2014 yang diikuti dua pasangan calon. Joko Widodo dan Muhammad Jusuf Kalla ditetapkan sebagai presiden dan wakil presiden periode 2014-2019.
